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RE:【其他】線上玩家合力解開愛滋病毒重要基因

樓主 光山 tcss0612
GP37 BP-

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下載:
有三種作業系統的版本
http://fold.it/portal/download/windows
http://fold.it/portal/download/osx
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攻略:
遊戲目的就是要折疊出正確的蛋白質,蛋白質有很多規則需要遵守,後面我會詳細敘述。

遊戲一開始會先更新蛋白質資料庫:


此遊戲需要註冊帳號,這樣你解出來的蛋白質才會被上傳到資料庫裡面給科學家看。
應該不需要我教吧?



登入之後就能選關卡了,遊戲關卡分成三類:
新手教程>>教你基本操作和基本生化知識
已知蛋白質>>一些已經知道正確結構的蛋白質,如果連這些你都無法破關.......
未知蛋白質>>真正需要被破解的蛋白質 比如HIV殼蛋白之類的



光山已經把新手教程破完了,不過還是陪大家走一次。
1-1側鏈摺疊
蛋白質是由胺基酸長鏈構成的,可分成主鏈和側鏈。兩種都可以轉動,你可以用滑鼠拖拉側鏈。
如果測鏈靠太近,就會出現紅色球體表示{碰撞},你要把測鏈托拉到合適地位置解開碰撞
上方的記分板會隨著你托拉而改變,以本關為例到達7900分就能過關。

1-2進階側鏈摺疊
很簡單,跳過

1-3 搖晃
遇到像這種一大坨的多肽時,可以用{搖晃shake} shake功能在左下角,他會一次把所有側鏈都搖來搖去,讓大多數的碰撞解開。他會不停的搖晃各種可能性,等到你覺得可以的時候,按下左上角的停止...


2-1主鏈碰撞
除了側鏈會靠太近,主鏈也會有碰撞。你也可以用滑鼠把它解開。



2-2主鏈空隙
靠太遠也會有問題,會產生空隙。你也可以用滑鼠讓主鏈互相靠近,把空隙填滿。

2-3搓揉WIGGLE
就像測練可以用SHAKE,你可以wiggle主鏈,基本操作都一樣。
搓揉的圖示是兩個旗子



3-1 氫鍵
兩個擁有正確化學性質的主鏈之間會產生氫鑑,以水藍色螺旋表示,可以大幅增加蛋白質穩定性,意思就是值很多分數。
這種板子形狀的主鏈稱為Beta折板,你要讓他們靠在一起

3-2橡皮筋
wiggle雖然很好用,但是有時候還是會出錯。
使用橡皮筋把你想要讓他們特別靠近的主鍊綁在一起,我的意思當然是要你把兩個beta板靠在一起。按著shift鍵你就能在兩個主鏈之間綁上橡皮筋,會以紫色顯示出來。
綁完之後再wiggle,就能讓某些部份靠在一起。
  
3-3 進階橡皮筋應用
這個多肽包含了3段的beta折版,你要用多根橡皮筋把他們綁起來再wiggle。

3-4 凍結
這陀蛋白質右半邊的beta版都已經折好了,為了避免你處理左邊時把右邊弄亂,你要使用凍結功能。按著shift鍵再點主鏈或側鏈,被你點到的地方就會被凍結,連點兩下可以把alpha螺旋或beta折版整個凍結。

3-5顏色與重組rebuild
這些主鏈的顏色代表他們的摺疊程度,綠色是完美摺疊,紅色是狗屎摺疊。
這個紅色的loop需要被搞定,對著她點右鍵,用rebuild把它的形狀改掉。
等到他變出一個合適的形狀時再按stop。

  
4-1 把疏水側鏈埋起來
疏水性側鏈喜歡被包在蛋白質的中間,親水性側鏈喜歡在外面。
疏水性側鏈會用橘色表示,親水性側鏈則是水藍色。
如果疏水性側鏈不幸裸奔了,會有黃色球體出現,你要把他們拉到正確位置。
4-2 旋轉tweak
這個alpha螺旋上面有兩個酪氨酸裸奔了,你要讓alpha螺旋轉動一下好讓他們兩個可以被包在裡面。對著螺旋使用tweak,會出現紫色箭頭,按著紫色箭頭就能轉動他,順或逆時針都可以。
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