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RE:【情報】中國武漢疫情情報整理

樓主 光山-Kohinoor tcss0612
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【武漢編年史】 卷二:擴散與封城
【武漢編年史】卷一:起源 2019~2020/1/13
【武漢編年史】卷二:擴散與封城 2020/1/13~1/23
【武漢編年史】卷三:緊急事件與CHO的誕生2020/1/23~2020/1/31

此卷記錄了2020/1/13~1/22日之間的事件。
中國病例一直維持41例,卻在泰國出現了病例。不安的氣息在專家間流竄,傳染病學家們的擔憂無法掩蓋。
直到中國宣布,武漢封城。

1/15
台灣修法完畢,將「嚴重特殊傳染性肺炎」列為第五類傳染病,將可以強制抓人隔離。

1/16
日本
日本厚生勞動省指出,日本國內首次確認的新型肺炎感染者是居住在神奈川縣的30多歲中國籍男性,1/6日從武漢市回到日本,1/10住院,1/15日康復後出院。

台灣
疾管署的參訪團回到台灣了。醫療網指揮官莊銀清表示:「到當地後主要去參觀疾病控制中心,聽取有關疫情調查以及防治作為,當時陸方還不敢確定有人傳人現象,但有連續兩起家庭群聚感染,發現疫情有明顯變化」。
專家分析41起案例中,有7成的人到華南海鮮市場,3成(13人)沒有去過市場。
時空旅人光山劇透警告:台灣參訪團看過後也覺得會了,理論上這個時間點中國就該知道有強烈人傳人能力了


光山:沒去過市場的這13人應該就是人傳人的案例了。有家庭感染的案例,顯示親密接觸是個可以傳染病毒的方法,例如一起吃晚餐,搶電視遙控器這類的互動。
有玩過plague inc都知道,感染人數要夠多才會開始出現紅飛機(帶有感染者的飛機),跨國傳染。直到1/16已經有兩台紅飛機了,幾乎可以肯定中國有下修感染人數。這幾個病例都是一下飛機就被抓到,先給海關人員一個讚好消息是中國給的基因訊息非常有用,泰國和日本都成功抓包。

中國
時光旅人:武漢市在1/16號這天獲得了檢測能力。在這之前病人樣本要送到北京的研究所才能檢查。來回要花3~5天。也就是說這段時間內的病患人數都是Lag至少三天的。


1/17除夕倒數7天,根據往年紀錄 這七天是人潮最高峰。
泰國
抓到了第二名2019-nCoV病例

中國網友表示:
只有湖北省有病例,其他省都沒有傳出病例,日本和泰國卻出現新病例。
這個病毒是愛國病毒呀,要擴散都不會在國內擴散,只會擴散到外國呢。

時空旅人光山劇透警告:愛國病毒全面擴散

中國
出現第二起2019-nCoV死亡病例,患者是69歲男性,肺部纖維化,很可能已有長期肺結核感染。
死於多重器官衰竭。
光山:肺結核助攻很會喔

英國報導:
據《BBC》報導,傳染病專家弗格森(Neil Ferguson)教授指出,儘管疫情以武漢為中心,但目前泰國已出現2起病例,日本則有1起,這讓他非常擔心,因為要讓武漢疫情於國外出現3起病例,這代表著當地感染者比官方的數據多出不少
弗格森與倫敦帝國學院的同事,進行了電腦模擬,考慮到有多少人從武漢飛到泰國,要有多少人感染才會剛好有感染者在飛機上等等數據。顯示應該要有1200~1700人感染,才會出現泰國病例。

這和光山玩plague inc時出現兩台紅飛機的人數不某而合,巧合嗎? 我不這麼認為。
看來Plague inc的遊戲提示都是真的(遊戲引擎參考真實世界數據)

CHO:
發表了一篇檢測病毒的說明書。
CHO建議,進行病毒檢查和DNA測定的實驗室安全等級,可以比照流感病毒處理。
(大醫院就有的實驗室防護安全等級)。如果要培養病毒,需要更高級的生物安全實驗室。
PS:中國只有一個生物安全第四級實驗室,於2018年1月在武漢開張使用。

1/18
研究進度:
光山終於找到網路上的免費資源了。Genebank上面已經流放了2019-ncov的完整基因序列。
中國似乎找到了5個病毒分離株,不過能免費看到的只有一個,Genebank番號MN908947。其他有帳號才能觀看的平台(GISAID)上則是5個序列都有。

1/18
中國
新增17個病例,累積62例。其中包含沒有去過市場,也沒有和懷疑對象接觸的人。
顯示病毒封鎖網有漏洞,有未知的感染源頭。
深圳出現疑似病例。

1/19
武漢增加136人
北京確定兩例
深圳確定1例
中國累積病例達到201人

光山:選情愈來愈樂觀。

1/20
南韓:出現一名確定病例。
患者是一名35歲中國籍女性,1/19搭機從中國武漢抵達仁川國際機場。於入境出現高燒等症狀,因此遭到隔離。
浙江省傳出有5個疑似病例

香港大學感染及傳染病中心總監何栢良表示:
鄰近香港的深圳市已出現2019ncov個案,由於港深交流頻繁,未來病毒傳入香港的機會高。


光山肝尼老師。突然爆出這麼多人,中國肯定有隱匿疫情。
新增加的病人中,很多人根本沒去過市場,也沒有和監測對象接觸過。
也就是說,這些病人是從中國不知道的地方感染到的。有不知道在哪裡的傳染源正在外面趴趴走!

1/20
中國
武漢累積198人
北京累積2人
深圳累積1人
中國累積病例達到136人。
中國國家主席習近平對疫情作出重要指示。
一名有高血壓,糖尿病與心臟病的患者,死亡。總死亡人數來到4人。
傳染病首席鐘南山表態確認會人傳人,有個病人感染了14位醫護人員。這是中國第一次開金口確認會人傳人,以及有醫護人員感染的狀況。

武漢有15名醫護人員遭到2019ncov感染。2019ncov有人傳人之能力,已是明顯事實。

光山:
他媽的這根本是教科書上的超級傳播例子阿。一般來說,疾病通常只能傳染1~3個人,看疾病的特性而定。但有些病人很超級,到處亂跑或者剛好有特殊效果,這種病人就有可能一次傳染給一堆人。
例如去年台灣麻疹暴發,零號病患回到台灣後就傳染了5人。而傳說中的傷寒瑪莉傳染了53人。

台灣:
成立疫情指揮中心

1/20
網路上的謠言流傳一份"武汉肺炎保密报告",理面說到患者有免疫系統攻擊肺部、病患沒有發燒等敘述。據說是中國內部的保密錄音。
分享這篇報告的人都有散播謠言的嫌疑。不過因為我是時空旅人,不是在1/20號分享的所以沒關係
時空旅人光山劇透警告:免疫系統攻擊肺部是真的,柳葉刀研究證明加護病房的病人有免疫風暴的現象。沒發燒也是真的,中國官方已經在1/26證實不發燒也會傳染了。

1/21
武漢累積198人
北京累積5人
深圳累積9人
上海一人
株海3人
勘江1人
惠洲一人
中國累積病例達到218人,大量病例出現在武漢以外的城市與省份。
中國宣布武漢肺炎是乙類傳染病。

香港專家袁國勇分析表示;感染可分為三階段。
第一階段是病毒從動物感染給人,這發生在市場。
第二階段市場相關人士感染給附近的人。
第三階段是家庭;醫院等公眾場合的傳播。

一但到達第三階段,病毒就會快速擴散到武漢以外的地區。香港專家袁國勇認為現在是第三階段的初期,必須進快防堵。
時空旅人光山劇透警告:你甚麼時後產生了第一個醫院感染案例是在今天(1/21)的錯覺的? 12/29號就有醫院感染的案例了,第三階段初期是12/29才對。該死,用時空旅人的視角看,當時的我們LAG了整整兩周以上啊

袁國勇表示,香港當局對2019ncov的預防措施,比其他地方嚴厲許多,因為香港有過SARS的慘痛教訓。他也認為,突然暴增的案例,可能是因為中央研發出篩檢藥劑,並發放到地方,篩檢量突然增加,才讓診斷數量也突然增加。

時空旅人光山劇透警告:香港的過度反應是正確的。
1/21
台灣
疾管局召開記者會表示,台灣有首例確診病患。
台灣人,南部50多歲女性,於中國大陸武漢工作,去年12月就待在武漢地區,沒去過華南市場,沒有接觸禽鳥。
於1/11日出現感冒症狀,因為不相信中國醫院沒有就醫。1/20由武漢搭機入境,上機前就有症狀,帶著口罩。主動告知檢疫人員後,由機場檢疫人員安排就醫,X光檢查顯示有肺炎。
於1/21日檢驗確認為2019ncov陽性,持續於醫院負壓隔離病房治療中。目前健康狀況十分穩定,十分配合。這也是第一起非中國國籍的病人感染的案例。

莊人祥表示將加強隔離政策。只要12天內去過中國,有肺炎症狀就一率抓起來隔離。

蘇貞昌宣布成立第三級疫情指揮中心

1/21
研究進度
中國發表有關病毒的第一篇研究
Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission
關於在武漢傳播中的新種冠狀病毒期間刺蛋白的構造演化與人傳人能力的關聯

利用公開的基因情報,重建模擬了病毒的蛋白質並且讓他在電腦裡面和虛擬人類細胞結合。

冠狀病毒都是靠S蛋白與細胞結合達到入侵的。SARS病毒是用S蛋白與ACE2結合入侵的,MERS則是S蛋白與DPP4結合入侵。
研究者先比較了這三種病毒的S蛋白基因序列,發現2019ncov與SARS的S蛋白最接近。
所以猜測應該和SARS一樣,也是與ACE2結合的。

但仔細比較後發現,在關鍵點的位置,有4個變異。應該要彼此緊密貼合的位置上,2019ncov的5個位置中有4個和SARS病毒不同。既然這樣那他還是不是會結合呢?

為了釐清這一問題,不能只看DNA,而是模擬出了一整個完整的蛋白質。

結果顯示,雖然SARS和2019ncov的S基因十分不同,但最後形成的S蛋白,折疊構型卻幾乎相同。也就是說,雖然程式碼不一樣,但最後呈現出的外型結果卻極接近。2019ncov的S蛋白和ACE2,進行模擬結合成功。顯示他應該可以用這種方法感染細胞。

強度上的比較,SARS病毒的S蛋白,和ACE2的結合自由能是 –78.6 kcal摩爾–1。
2019ncov稍微弱一點,只有–50.6 kcal摩爾–1,但還是很高。一般認為–10 kcal摩爾–1以上才有意義,他顯然有達到標準。

光山:可以推測2019ncov入侵細胞方法應該和SARS一樣(經由ACE2),所以入侵用的蛋白才會長一樣(但DNA序列結構不一樣)。不過會比SARS稍微弱一點點。這些推論都還需要用真的病毒和真的細胞作一次實驗才能確認,不過中國應該是沒時間也沒膽進行這種實驗了。

時空旅人光山劇透警告:中國馬上就用基改細胞作了一次病毒感染實驗了,看來中國科學院武漢病毒研究所有在好好的運作呢

1/22
美國
CDC記者會宣布一名男子於1/15返回美國西雅圖後,出現感冒發燒症狀。由於曾去過武漢,院方懷疑感染2019ncov,經檢驗後隨即確認。

光山:CDC的大本營就在西雅圖ㄟ,被秒篩

中國
感染總人數增加到440人,死亡9例。

武漢:经请示上级有关部门同意,武漢市設立了生物安全實驗室,進行2019-ncov病毒的篩檢。

北韓
宣布撤底封鎖與中國的邊境

江峰漫談20200122第101期 這位YT主在視頻中預測,大量身穿防護衣的士兵會在近期出現於武漢的街頭。武漢市向中央請求400萬套防護服,這麼多給誰穿? 整個武漢市政府也沒400萬人。一定是給解放軍穿的。

香港
香港出現一名確診案例,患者39歲,由武漢來港,昨日(21日)由武漢車站乘坐G1015高鐵到深圳北,於晚上由深圳北乘坐G5607班次抵西九龍站。患者當日出現發燒和鼻塞徵狀,被港口衞生處職員發現,他向職員表示曾到武漢,其後被送到伊利沙伯醫院作進一步檢測。
該人表示,自己過往健康良,無去過醫院、濕貨市場,無接觸過野生動物及家禽,亦無與確診患者接觸。

光山:flag滿滿,這傢伙是被人傳人感染的。病毒已經有完整的擴散能力了,而且不限於市場或醫院這些高風險地區就能感染。


香港出現第二患者,該患者於1/19因為身體不舒服到院看診,由於他沒有任何可疑症狀,醫院並沒有隔離他。但他說自己曾去過武漢,因此醫院要求他兩天後,在1/21日回診。回診時狀況惡化,出現肺炎症狀,檢查後發現2019NCOV陽性,已經隔離。

澳門
出現一名確診案例,一名52歲的女子,1/19日由武漢乘高鐵到珠海,同日晚上經關閘到澳門,之後乘巴士到新東方置地酒店,曾在酒店附近吃東西,大部分時間都是與兩名朋友在賭場逗留。1/21傍晚該名女子自行到仁伯爵綜合醫院求診,確診感染2019ncov,與她同行的兩名朋友亦送院隔離14天。

1/22
王廣發發文表示,他覺得病毒或許可以從眼睛進入感染。他就是那個,前一天說可控制,第二天就發病的專家。他認為自己可能是有戴口罩卻沒戴護目鏡中招的。本光山覺得這個理論很有說服力。

最有可能的是两个节点。一是到武汉第二天去金银潭医院去ICU看重症病人,正好赶上插管。我有一个近距离的接触。但都是全副武装,戴着防溅屏,感染的可能极小。另一个节点是在回京前2天去了几家医院的发热门诊和临时隔离病房,有的医院的发热门诊比较拥挤,里面很可能存在新冠状病毒肺炎的患者。当然我们也高度戒备,都是戴N95口罩进入。现在回想起来,在发热门诊感染的可能性最大。我现在突然意识到,我们没有配备防护眼镜。一个重要的线索是,我回京后出现最早的症状是左下眼睑的结膜炎,很轻。2-3个小时后出现了卡他症状和发热。基于我看到的病例,还没有以结膜炎为首发表现的。当时我还以此为依据,把自己排除在新冠状病毒肺炎之外,而更多地考虑是流感。但经抗流感治疗无效,发热时断时续,最后做了新冠状病毒核酸检测,呈现阳性。说明我的结膜炎很可能也是新冠状病毒引起,而且是局部结膜首发。因此高度怀疑是病毒先进入结膜,而后再到全身。如果这个推测成立,则我的防护盲点就在没有戴防护镜。

1/23
中國:
感染總人數增加到569人,死亡17例。
武漢是最嚴重的地區,一天內就增加了62個病例。

武漢宣布關閉所有機場、港口、公車站火車站。(武漢在長江旁邊所以是有港口的)


1/23
研究進度:
中國發表了關於病毒起源的研究:
Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human
這篇研究指出,2019ncov應該是多種冠狀病毒重組融合的產物(病毒本來就會互相融合,你看流感每年都會變,那些數字就是每年隨機融合的結果)。


2019ncov的主要成分是蝙蝠冠狀病毒,但是病毒表面用來入侵細胞的尖刺蛋白,被替換(同源重組)成了一種新的尖刺蛋白。資料庫裡面沒有對應這種尖刺蛋白的病毒,是來自一個未知的病毒。

可以推測,2019ncov,應該是蝙蝠冠狀病毒與一種未知的冠狀病毒,融合交換了尖刺蛋白,才誕生出來的。在DNA發表的第一天大家就猜到了,2019ncov應該和蝙蝠病毒有關,但不知道是突變,演化還是重組,現在看起來應該是屬於重組。

而蝙蝠病毒的部分,最接近的是舟山蝙蝠病毒(bat-SL-CoVZC45),可以和2019ncov組成單系群,彼此應該是姐妹關係。

該研究推論可能是因為尖刺蛋白被替換(同源重組)了,所以讓蝙蝠病毒可以感染人類。

這篇研究還比較了密碼子習慣,可以把他想像成病毒的打字習慣。發現和蛇的最接近,所以認為是從蛇身上跑來的。


本光山認為只靠這種薄弱證據就說是來自蛇太過隨便。對支序分類學有點了解都會知道,採樣數量不足的危險。
如果有一天外星人來地球研究,只抓到人類,貓,蟑螂和雞這幾個樣本,就會得出貓是與人類最接近的生物的錯誤結論。現在的狀況就是這樣。

拿現有的資料庫中最接近的那個答案,就說是這個生物,也太隨便了吧? 從記者的高潮反應看來的確是太過隨便了。
況且支序分類學就是門會一直上patch,一直更新修正的學問,細節隨時都會變。在更多採樣點出來前,說來自蛇參考就好。不過大方向,也就是蝙蝠的部分應該是對的。

蝙蝠的部分,採樣數量很多,而且有SARS的案例,本光山認為十分可信。
我贊同他是蝙蝠+不明病毒重組的結論。我反對不明病毒是蛇病毒的論點。




1/23
新加坡
一名來自武漢的66歲男子,他與9名同伴一起乘坐中國南方航空公司 CZ351航班從廣州飛來,並留在香格里拉聖淘沙度假溫泉酒店。旅館工作人員和航班乘客的已經被納入監控追蹤。


越南
中國父親從武漢前往河內探望其在越南的兒子。他已經把疾病傳染給了兒子。



沙烏地阿拉伯
印度外交部表示,一名在沙烏地阿拉伯工作的印度籍護士遭到感染。
沙國方面尚未回應。
印度外交部連忙刪文,該名護士感染的其實是MERS,嚴重中東呼吸道症候群。
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