《忍者亂太郎 忍術學園 全員出動！》將以原著的漫畫單行本第 37 集作為中心，描述在暑假結束後，正打算前往一年級教室的亂太郎、霧丸以及新兵衛，卻發現同學喜三太因為搞錯了習題而捲入麻煩中，亂太郎等人於是在學園長的命令之下，準備救出喜三太！...（繼續閱讀）